La Secretaria Científica brinda apoyo a la formación profesional permanente a través del mantenimiento del Centro de Información Documentaria. Brinda un espacio físico a las Sociedades Científicas, nudo del desarrollo y actualización permanente de las especialidades médicas. A través de la Revista Científica de la Asociación Médica de Bahía Blanca, que se publica desde el mes de julio de 1984, fomenta y difunde la actividad de investigación local, regional y nacional.

La Revista Científica ha sido incorporada a Lilacs, mérito de aquellos que rigieron esta Secretaría en los últimos 15 años, como los Dres. Marcelo García Dieguez, Jorge Picorel y Dr. Horacio Maturi.